企业和个人注册商标没有实质性区别，只是一个商标归属权的问题，公司申请的，归公司所有，个人注册则为个人独自享有。但从转让和变更两个方面来看，会有一定的区别。从转让上来看

公司名义下的商标需要对外转出时，因为权属于公司，需要公司所有股东的同意才可以进行对外转出，个人名义下的商标，因为权利比较集中，可以凭独立意志，将商标进行转出。

从变更的方面来看

国家商标法第41条规定，注册商标需要变更注册人的名义、地址或者其他注意事项的，应当提出更申请，个人名义下不易发生变更，因为申请在个人名下的商标，申请人主体的名称，身份证号以及地址不会轻易发生改变，商标信息也不需要随之改变。这是个人名下的商标，比较优势的一点，当然也有缺点，它的劣势就是商标法里面还有规定，凡注册成功满三年的商标，任何自然人都可以对其提出撤销，一旦商标被撤销，那个人名下的地址不容易收到商标局发过来的撤销答辩文件，这样就会非常容易，导致商标无效。公司名义下的商标相对于个人名下的商标来说稳定得多，公司名称和地址容易跟随公司的经营范和发展发生变更，这样就要求商标，商标也要跟着工商变更保持一致。虽然变更程序可能会增多，这样也能有效防止将来别人对我们的商标提出撤销三年不使用因为收不到撤销文件，而失去答辩的机会，导致商标无效的可能。

因此是选择用公司还是个人主体注册商标，要根据自己的实际情况选择。